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行業前沿

GFP標記的應用和載體系統

發布時間:2020-07-19 點擊數:
綠色熒光蛋白(GFP)等蛋白質的生物發光和熒光可能在水母等生物中存在了數百萬年;然而,直到20世紀60年代,科學家們才開始研究GFP并推斷其生化特性?,F在,GFP及其熒光衍生物已成為實驗室的主要研究對象。GFP被廣泛應用于生物學領域的研究,科學家們利用GFP實現多種功能,包括:標記基因以闡明其表達或定位特征,充當生物傳感器或細胞標記,研究蛋白質之間的相互作用,可視化啟動子的活動,等等。

為什么是綠色熒光蛋白?

GFP是一種約27kda的蛋白質,由238個氨基酸組成,來源于水晶水母aequoreavictoria。它在可見光譜的綠色部分具有熒光發射波長(因此得名),這是由于蛋白質中心的三種特定氨基酸(Ser65Tyr66Gly67)的成熟反應形成的生色團。當第一次被發現時,GFP最令人驚訝的一個方面是發色團是自發形成的,沒有額外的輔助因子、底物或酶活性,它只需要在成熟過程中有氧存在。這意味著蛋白質可以直接從A到B,并在任何生物體中表達,同時仍保持熒光。

1996年首次報道的蛋白質結構是11β-包含“Barrel”形的薄片,發色團隱藏在結構的中心,不被水溶劑淬火。這種緊密排列的結構解釋了整個GFP蛋白的重要性,它幾乎完全是維持熒光活性所必需的;與當時的傳統熒光染料相比,GFP的主要優勢在于它無毒,并且可以在活細胞中表達,從而可以研究動態的生理過程。

重新設計GFP以增加其顏色和應用范圍

幾乎在它的序列被闡明之后,科學家們就開始通過突變來改造GFP的新版本,以改善其物理和生化特性。1995年,羅杰YTsien描述了一個S65T點突變,它增加了GFP的熒光強度和光穩定性。這也將其主要激發從395nm移到了488nm,有效地改善了野生型蛋白的缺陷,促進了其在研究中的廣泛應用。許多其他的突變已經被引入到GFP中,新的熒光團不斷被設計。下表1列出了幾種常見的熒光蛋白及其相對于野生型GFP的突變。雖然這里沒有列出,但每種顏色中的許多滲透也存在,它們之間只有細微的差別。

請注意,在光譜的紅色部分發現的許多熒光蛋白不是GFP衍生物,而是與從Discosoma sp.分離的dsRed蛋白有關。已經做了類似的工作來擴展紅色熒光蛋白庫;然而,這些蛋白質是獨特的綠色熒光蛋白和突變定義中發現的表2可能不適用。

表1:包含普通熒光團的特異性突變

表二:GFP衍生物特異性突變的功能作用

多種應用

由于GFP及其易用性,GFP等熒光蛋白已成為分子生物學的主流??茖W家可以很容易地利用含有GFP的質粒作為一種手段,達到許多功能目的,以下是一些常用的用途,但是目前還有許多其他的用途,并且新的GFP技術正在不斷發展!

融合標記GFP是最常見的用途之一,它可以與蛋白質的N-C-末端融合,這使科學家能夠可視化基因表達的時間和地點。

轉錄報告員:將GFP置于感興趣的啟動子的控制下,可以用來有效地監測特定細胞類型中啟動子的基因表達。這種轉錄報告是GFP最早的應用之一。

F?rster共振能量轉移(FRET):這是用來研究兩個蛋白質之間的相互作用,或在兩個蛋白質域之間發生構象變化的相互作用。典型地,使用了兩種具有重疊激發/發射光譜的熒光蛋白;融合到每個正在測試的蛋白質或域的一個。在這里找到微動質粒。

分裂EGFP作為一種替代fet的方法,拆分EGFP也被用來研究蛋白質與蛋白質的相互作用。在這種情況下,EGFP的兩部分融合到感興趣的蛋白質中,當它們接近時,EGFP的兩部分經歷折疊、成熟和熒光。

生物傳感器:采用FRET、鈣調蛋白等多種策略,設計了一系列基于GFP的熒光生物傳感器,用于檢測各種細胞內條件,包括離子(如Ca2+)濃度和pH等。

光遺傳學:科學家可以利用光來檢測、測量和控制分子信號、細胞和細胞群,以了解它們的活動,并可視化改變對這種活動的影響。了解更多關于光遺傳學的開放式光遺傳學,并在Addgene找到光致執行器和傳感器。

細胞標記/選擇:表達結構如質粒通常包括GFP作為標記,以幫助識別哪些細胞成功地獲得了質粒。這可以作為選擇抗生素的替代品。這種類型的質粒可能在感興趣基因的附加啟動子的控制下,或與感興趣基因相同的轉錄子表達GFP,但在內部核糖體進入位點(IRES)之后。這通常用于FACS的連接(見下文)。

熒光活化細胞分選(FACS:這是一種流式細胞術,它根據熒光信號將細胞混合物分離成不同的群體。因此,FACS可以用于將表達GFP的細胞與非GFP的細胞分離。

發育/轉基因用途GFP由于其穩定性,可用于細胞命運研究中的遺傳跟蹤能力。當利益促進者控制時,它也可以用來形象地顯示這些促進者活躍的發展階段。此外,GFP還可以標記經轉基因ES細胞,然后可用于轉基因小鼠的植入和生成。

純化GFP可作為蛋白質純化的一般表位標記,并可獲得大量的GFP商業抗體。

其他:我們只是在為GFP的潛在應用程序的表面劃傷了一下。它還被用于在藥物篩選中識別特定細胞群,在癌癥研究中可視化裸鼠的微轉移,充當DNA雙鏈斷裂修復的報告員,并標記致病性細胞內微生物,以可視化宿主/病原體相互作用。

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